La sûreté aérienne est la priorité de la GTA. Cette priorité été accentuée après les attentats du 11 septembre 2001. Elle représente une part très importante de son activité puisque plus de 60 % de ses missions y sont consacrées.

Après le crash du Concorde en 2000, il est apparu indispensable de créer une unité dotée de personnels spécialisés et de matériels spécifiques, projetables pour rechercher les responsabilités et expliquer aux côtés du BEA, les causes d’un accident.

Equipes cynophiles spécialisées en recherches d’explosifs et stupéfiants, tireurs d’élite entraînés et spécialisés, drones de surveillance, sont autant de moyens spécialisés mis en œuvre par la GTA pour assurer ses multiples missions.